MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 plasmid pALVIN02

Total Repeats: 562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013862	GACG	2	8	34914	34921	25 %	0 %	50 %	25 %	288986973
502	NC_013862	GTC	2	6	34982	34987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288986973
503	NC_013862	ACCT	2	8	35017	35024	25 %	25 %	0 %	50 %	288986973
504	NC_013862	AGA	2	6	35046	35051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288986973
505	NC_013862	CGG	2	6	35135	35140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288986973
506	NC_013862	TGAAT	2	10	35184	35193	40 %	40 %	20 %	0 %	288986973
507	NC_013862	A	7	7	35307	35313	100 %	0 %	0 %	0 %	288986974
508	NC_013862	CGAT	2	8	35317	35324	25 %	25 %	25 %	25 %	288986974
509	NC_013862	T	6	6	35333	35338	0 %	100 %	0 %	0 %	288986974
510	NC_013862	AAT	2	6	35364	35369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288986974
511	NC_013862	ACC	2	6	35389	35394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288986974
512	NC_013862	TTGA	2	8	35396	35403	25 %	50 %	25 %	0 %	288986974
513	NC_013862	GGA	2	6	35464	35469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288986974
514	NC_013862	AAT	2	6	35523	35528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288986974
515	NC_013862	ACT	2	6	35595	35600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288986974
516	NC_013862	TCA	2	6	35602	35607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288986974
517	NC_013862	A	6	6	35763	35768	100 %	0 %	0 %	0 %	288986974
518	NC_013862	TTC	2	6	35769	35774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288986974
519	NC_013862	GAT	2	6	35777	35782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288986974
520	NC_013862	GGTA	2	8	35845	35852	25 %	25 %	50 %	0 %	288986974
521	NC_013862	A	6	6	35876	35881	100 %	0 %	0 %	0 %	288986974
522	NC_013862	CAT	2	6	35895	35900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288986974
523	NC_013862	A	7	7	35938	35944	100 %	0 %	0 %	0 %	288986975
524	NC_013862	ATC	3	9	35954	35962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288986975
525	NC_013862	AAC	2	6	35966	35971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288986975
526	NC_013862	T	6	6	35982	35987	0 %	100 %	0 %	0 %	288986975
527	NC_013862	TCT	2	6	36024	36029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288986975
528	NC_013862	T	7	7	36079	36085	0 %	100 %	0 %	0 %	288986975
529	NC_013862	GTT	2	6	36120	36125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288986975
530	NC_013862	TAAA	2	8	36397	36404	75 %	25 %	0 %	0 %	288986975
531	NC_013862	AAC	2	6	36643	36648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288986976
532	NC_013862	TGA	2	6	36664	36669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288986976
533	NC_013862	ACT	2	6	36727	36732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288986976
534	NC_013862	TGC	2	6	36761	36766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288986976
535	NC_013862	AAC	2	6	36790	36795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288986976
536	NC_013862	TTC	2	6	36950	36955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288986977
537	NC_013862	T	6	6	37007	37012	0 %	100 %	0 %	0 %	288986977
538	NC_013862	AAT	2	6	37017	37022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288986977
539	NC_013862	AAT	2	6	37066	37071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288986977
540	NC_013862	GTT	2	6	37203	37208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288986977
541	NC_013862	TCC	2	6	37212	37217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288986977
542	NC_013862	CTG	2	6	37237	37242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288986977
543	NC_013862	TCA	2	6	37400	37405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288986977
544	NC_013862	ACC	2	6	38063	38068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288986978
545	NC_013862	TTG	2	6	38105	38110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288986978
546	NC_013862	GAC	2	6	38202	38207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288986978
547	NC_013862	GCT	2	6	38238	38243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288986978
548	NC_013862	AC	3	6	38251	38256	50 %	0 %	0 %	50 %	288986978
549	NC_013862	CCA	2	6	38270	38275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288986978
550	NC_013862	GCTC	2	8	38276	38283	0 %	25 %	25 %	50 %	288986978
551	NC_013862	AGG	2	6	38363	38368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288986978
552	NC_013862	TCT	2	6	39191	39196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288986979
553	NC_013862	CAAG	2	8	39253	39260	50 %	0 %	25 %	25 %	288986979
554	NC_013862	ATT	2	6	39311	39316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288986979
555	NC_013862	CTA	2	6	39324	39329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288986979
556	NC_013862	TGC	2	6	39426	39431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288986979
557	NC_013862	TGA	2	6	39588	39593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288986979
558	NC_013862	CAA	2	6	39661	39666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288986979
559	NC_013862	CTG	2	6	39777	39782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288986979
560	NC_013862	GA	3	6	39831	39836	50 %	0 %	50 %	0 %	288986979
561	NC_013862	GGA	2	6	39841	39846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288986979
562	NC_013862	TGAT	2	8	39870	39877	25 %	50 %	25 %	0 %	288986979

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